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关于利休的死因古来是个谜，我认为大德寺山门事件及倒卖茶具不过是导火线，真正的死因在于利休与秀吉俩人心灵上的鸿沟以及界城市的衰落和界商人被遗弃。同时秀吉的那种爱好奢华的“黄金茶室”美学观与利休的那种爱好清淡的“草庵茶室”美学观也是水火不相容的，它使俩人心灵上的鸿沟越来越深，最后俩人彻底破裂，从爱变成恨，从恨变成置于死地，这是历史上统治者一贯的残忍手段。
利休为避免大祸临头，请求别人帮助。细川三斋为他奔走说情，前田利家也劝秀吉息怒，但都没有成功。干利休还开设茶会招待德川家康，请求他出来解决此事，但也没有结果。终于1591年2月13日秀吉派遣使者富田左近、拓植左京俩人下令将利休遣送回界幽禁起来。
富田和拓植是千利休的茶友，劝他赶快离开京都回界。利休急忙坐船下淀川，在淀川的码头上送他的只有他的两名弟子细川三斋和吉田织部。
2月25日，不料事情发生急变，利休的木雕像被从大德寺山门上取下来，在京都一条庆桥处以腰斩，还将千利休从界唤回京都，赐予切腹。
2月28日利休切腹自杀，留下遗诗一首：
人世七十，力图命拙。
吾这宝剑，祖佛共杀。
提我得具足的一大刀，
今在此时才扔给天公。
利休自杀那天，天下大雨，雷电交加，在北野的坊官还下了冰雹哩！现在千利休的坟墓有三个；第一个是在荣光院，建于17世纪中期；第二个在南宗寺，建于元禄十三年(公元1700年)；第三个在大德寺本场内的开山塔背后。
利休切腹以后，儿子道安、养子少庵、孙子宗旦、妻子宗恩及女儿们都被流放到各地，后来他们得到赦免，发挥了千家的茶道传统。现在的表千家不审庵、里千家今目庵、武者小路千家官休庵三千家都是他们的后裔。
千利休是商人出身的茶匠，但赐予武士礼法的切腹，给时人冲击很大。这说
